ETF基金在二级市场上交易没有过户费、印花税，只收取一定的交易佣金，但申购、赎回需要交纳一定的过户费用。
深圳交易所与上海交易所对ETF基金收取的过户费存在一定的差异。在上海交易所，进行ETF基金申购、赎回时，按照相应组合证券过户面额的0.05%向投资者收取过户费，但在ETF基金成立后3年内按正常标准减半收取，即面额的0.025%，必须是涉及沪市股票成分的ETF基金。
在深圳交易所，投资者进行ETF基金申购、赎回操作，按照证券过户面值的0.025%向投资者收取过户费，但不向债券ETF基金收取过户费。
比如，小李，在沪市以1.5元的单价，申购ETF基金10000份，那么，小李需要交纳的过户费用=10000×1.5×0.05%=7.5元。
过户费是委托买卖的股票，基金成交后，买卖双方为变更证券登记所支付的费用，属于中国结算公司的收入，由证券公司代扣。
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